ביוכימיה/מבנה ואחסון של אינפורמציה גנטית - מבנה ה- DNA

מתוך ויקיספר, אוסף הספרים והמדריכים החופשי
קפיצה לניווט קפיצה לחיפוש

מבנה הנוקלאוטיד ( נוקליאוזיד פוספאט)[עריכה]

דנ"א היא מולקולה פולימרית הבנויה מתת יחידות מונומרים (=החוזרים על עצמם) שכל תת יחידה נקראת נוקליאוטיד או בסיס, או נוקלאוזיד '5 פוספט.

Ribose Heb.PNG

הנוקליאוטיד מורכב משלושה מרכיבים :

  1. קבוצת פוספט אי אורגני – קשור ל-'5 של הריבוז.
  2. סוכר 5 פחמני מסוג דיאוקסי (בפחמן '2 חסר קבוצה קרבוקסילית) ריבוז.
  3. בסיס חנקני – אחד מתוך 4 אפשרויות ; קשור בעמדת הפחמן '1 לריבוז. ההבדל בין הנוקליאוטידים (4 סוגים) נעשה על פי סוג הבסיס החנקני. סוג הנוקליאוטיד נרשם ע"פ האות הראשונה של הבסיס החנקני שלו.

סוגים עיקריים של נוקליאוטידים[עריכה]

  • A - אדנין (Adenine). מסומן כ : dATP.
  • C - ציטוזין (Cytosine). מסומן כ : dCTP.
  • G - גואנין (Guanine). מסומן כ : dGTP.
  • T - תימין (Tymine). צסוצן כ : dTTP.

כולם יחד (הנוקלאוטידים A,C,T ו-G) מסומנים : dNTP.

הבסיסים ותגובת הקישור בין הנוקליאוטידים (קשר פוספודיאסטרי)[עריכה]

קיימים 4 בסיסים : A, T,G ו-C. הם שייכים לשתי קבוצות של בסיסים :

כיווניות השרשרת (קצה 3' וקצה 5')[עריכה]

כל גדיל יכול להיות בעל שני כיוונים ('5 או '3) המסמנים מהיכן מתחילה השרשרת :

  • '5 – מסמל את תחילת הגדיל.
  • '3 – מסמל את סוף הגדיל.

ישנם שני סוגי גדילים :

  • גדיל מוביל – כיוונו מ : .
  • גדיל משלים – כיוונו מ: .

דגם הסליל הכפול של ה- DNA : הדגם של ווטסון וקריק[עריכה]

כיווניות הגדילים הבונים את הסליל וממדי המרחקים בסליל[עריכה]

כיוון הדנ"א הוא ימין
  • במבנה המרחבי הבסיסים פונים זה כלפי זה (על אותו מישור – קו אופקי). כאשר הם מאונכים לציר המרכזי של המולקולה הם מקבילים זה לזה.
  • קבוצת הסוכר והפוספט האי אורגני (נושאים מטען שלילי) פונות החוצה לתמיסה בגלל אופיין ההידרופילי ויוצרות קשרים עם התמיסה המימית (ציטופלזמה – חיידקים; נוזל גרעין – תאים אאוקריוטים).
  • כיוון סיבוב המולקולה הוא ימין.
  • תוך כדי הסתלסלות נוצרים שני חריצים : חריץ גדול (Manjor Grove) וחריץ קטן (Minor Grove).

הקשרים המייצבים את מבנה הסליל והמספר השונה של קשרי המימן בין הבסיסים השונים[עריכה]

הקשר שנוצר בין זוג גדילים הוא קשר מימן בין הבסיסים המקבילים (A מול T, G מול C) כאשר :

  • שני קשרי מימן יווצרו בין בסיס A לבסיס T ().
  • 3 קשרי מימן יווצרו בין בסיס G לבסיס C ().


דנטורציה ורנטורציה של ה- DNA[עריכה]

הקשר בין הרכב הבסיסים בסליל לבין תהליך הדנטורציה שלו[עריכה]

ככל שיהיו יותר קשרי מימן כך טמפרטורה ההתכה (Tm) לביצוע דנטורציה של הדנ"א תגדל. כלומר : ככל שיהיו יותר בסיסי G ו=C, כך, טמפרטורת ההתכה תהיה גבוהה יותר.

השפעת pH , טמפרטורה וחומרים שונים על דנטורציה ורנטורציה של DNA[עריכה]

פרק זה לוקה בחסר. אתם מוזמנים לתרום לוויקיספר ולהשלים אותו. ראו פירוט בדף השיחה.