ביוטכנולוגיה/גישות עיקריות לאיתור יצרני יתר
מתוך ויקיספר, אוסף ספרי הלימוד והמדריכים החופשי.
תוכן עניינים |
[עריכה] גישות עיקריות לאיתור יצרנים פוטנציאליים של תוצרים חדשים
[עריכה] איך מוצאים את המיקרואורגניזם החשוד כמייצר התרופה הנחוצה?
חיפוש מיקרואורגניזמים יצרנים מתבצע בנישות אקולוגיות קיצוניות, בהן שוררים תנאים מיוחדים. למשל :
- לאיתור אנזימים הפעילים בטמפרטורות גבוהות נחפש מיקרואורגניזמים תרמופילי (שחי בטמפרטורות גבוהות) במעיינות חמים.
- לאיתור אנזימים הפעיל בריכוזי מלח גבוהים נחפש מיקרואורגניזמים הלופילי (אוהב מלח) בים התיכון.
[עריכה] שיטות סריקה (=בדיקה ביולוגית - האם "התרופה" פועלת?)
[עריכה] in vivo (בתוך גוף בע"ח)
בדיקת התרכובת "החשודה" בתוך גוף של בע"ח ומעקב אחר פעילות התרכובת בתוך הגוף. השיטה הזו אינה יעילה מכמה סיבות :
- אף אחד אינו מבטיח שתגובה בבע"ח יהיה זהה לתגובה של גוף אנושי.
- כל ניסוי נמשך המון זמן ומספר הניסויים מוגבל (כמה ארנבות כבר אפשר לנצל?).
- השקעה כספית אדירה בטיפול יומיומי ורפואי בבע"ח.
- גוף של בע"ח הוא מערכת מורכבת - אין אפשרות לקבוע בוודאות על מה התרופה השפיעה, אפה היא הזיקה וכדומה.
[עריכה] הגישה התאית (In situ)
במקום השתמשות באורגניזם שלם, הבדיקה של השפעת התרכובת נעשת על תא בודד או מספר תאים.
[עריכה] הגישה המולקולארית (In Vitro)
בודקים השפעת התרכובת ישירות על החומר עליו היא אמורה להשפיע. אין פה מערכת ביולגית חיה והכול נעשה במבחנות. דוגמאות למבחני סריקה בגישה התאית :
דוגמא ראשונה : רוצים לבדוק האם חומר א' מבטל פעילות של פניצילנאז (= B לקטמאז). ידוע כי פניצילנאז הוא חומר הנמצא בקרב חיידקים העמידים לפניצילין (כלומר מפרישים את החומר).
הבדיקה נעשת : גידול חיידקים עמידים לפניצילין ולאחר גדילה הוספה אליהם את חומר א'. אם החיידקים לא גדלים סימן שהחומר טוב.
דוגמא שנייה : רוצים לבדוק האם אנזים פרוטאז הכן מפרק חלבון. ידוע כי החיידק המסוים מפריש פרוטאז.
הבדיקה נעשת : גידול חיידק על מצע עם קזאין (סוג חלבון). אם נוצר איזור צלול סביב המושבה האנזים פועל.
